Meißen als Bildungsstandort wurde schon im 16. Jahrhundert  bekannt durch die Gründung der Fürstenschule St. Afra. Heute lernen am Sächsichem Landesgymnasium St. Afra besonders begabte Kinder und Jugendliche.
Ein zweites Gymnasium, das Franziskaneum,  umfasst die Klassenstufen 5 bis 10 sowie die Jahrgangsstufen 11 und 12.
Die Gymnasien schließen mit der Abiturprüfung ab und verleihen die allgemeine Hochschulreife.

Bevor  ein Gymnasium besucht werden kann, besuchen alle Schüler die Grundschule. In Meißen stehen vier Grundschulen zur Verfügung. Nach dem Unterricht können die Schüler an der Hortbetreuung teilnehmen.
Nach der Grundschule entscheidet sich die Schullaufbahn, entweder Gymnasium oder Mittelschule.

In den  Meißner Mittelschulen wird allgemeinbildende und berufsvorbereitende Bildung vermittelt. Die Schüler erweben den Hauptschulabschluss oder nach bestandener Abschlussprüfung der Klassenstufe 10 den Realschulabschluss.

Als alternative Schule wäre die Freie Werkschule Meißen zu nennen. 

Die Allgemeinbildende Schule zur Lernförderung  und die Förderschule für geistig Behinderte helfen behinderten Kindern.

Zur beruflichen Aus- und Weiterbildung stehen das Berufliche Schulzentrum Meißen, das Berufsbildungszentrum, die Medizinische Berufsschule, Sozialpflegeschulen Heimerer gGmbH und die Innungschule der Kreishandwerkerschaft zur Verfügung.

Als sonstige Schulen sind die Deutsche Hahnemann Schule, die Euro-Schulen Riesa/Meißen GmbH zu nennen. Zu den Kunstschulen gehören die Kreismusikschule und die Jugendkunstschule.

Bildungseinrichtungen mit überregionaler Bedeutung sind die Fachhochschule der Sächsischen Verwaltung, das Bildungszentrum des Sächsischen Staatsministeriums für Soziales, die Akademie für öffentliche Verwaltung des Freistaates Sachsen, die Evangelische Akademie Sachsen, die Verwaltungsschule der Bundesanstalt für Arbeit, Sächsische Akademie für Lehrerfortbildung, Berufsakademie Mittelsachsen GmbH.

Die Stadt Meißen entwickelt sich zunehmend zu einem akademischen Bildungsstandort. Die Ansiedlung weiterer Spezial- und Sonderschulen wird angestrebt.